Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN3BO60391 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms