Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3O43889 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREB3O43889 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREB3O43889 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREB3O43889 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREB3O43889 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3O43889 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3O43889 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3O43889 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3O43889 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3O43889 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3O43889 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3O43889 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3O43889 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3O43889 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3O43889 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3O43889 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3O43889 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3O43889 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3O43889 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3O43889 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3O43889 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3O43889 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3O43889 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3O43889 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3O43889 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CREB3O43889 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms