Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRNO43815 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRNO43815 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRNO43815 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRNO43815 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRNO43815 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRNO43815 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
STRNO43815 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRNO43815 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRNO43815 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRNO43815 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRNO43815 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRNO43815 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRNO43815 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRNO43815 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRNO43815 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRNO43815 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRNO43815 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRNO43815 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRNO43815 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRNO43815 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRNO43815 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRNO43815 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRNO43815 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRNO43815 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRNO43815 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms