Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms