Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATCO43716 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATCO43716 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATCO43716 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATCO43716 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATCO43716 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATCO43716 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATCO43716 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms