Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA2O43364 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms