Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DYNC1LI2O43237 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DYNC1LI2O43237 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms