Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms