Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms