Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CUX2O14529 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CUX2O14529 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CUX2O14529 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CUX2O14529 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CUX2O14529 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CUX2O14529 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CUX2O14529 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CUX2O14529 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CUX2O14529 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CUX2O14529 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CUX2O14529 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CUX2O14529 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CUX2O14529 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CUX2O14529 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CUX2O14529 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CUX2O14529 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CUX2O14529 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CUX2O14529 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CUX2O14529 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CUX2O14529 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CUX2O14529 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CUX2O14529 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CUX2O14529 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CUX2O14529 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CUX2O14529 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CUX2O14529 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CUX2O14529 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CUX2O14529 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CUX2O14529 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
CUX2O14529 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
CUX2O14529 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CUX2O14529 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CUX2O14529 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CUX2O14529 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CUX2O14529 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CUX2O14529 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CUX2O14529 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CUX2O14529 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CUX2O14529 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CUX2O14529 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CUX2O14529 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CUX2O14529 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CUX2O14529 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CUX2O14529 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CUX2O14529 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CUX2O14529 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CUX2O14529 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CUX2O14529 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CUX2O14529 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CUX2O14529 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CUX2O14529 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CUX2O14529 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CUX2O14529 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CUX2O14529 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CUX2O14529 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CUX2O14529 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CUX2O14529 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CUX2O14529 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CUX2O14529 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CUX2O14529 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CUX2O14529 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CUX2O14529 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CUX2O14529 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CUX2O14529 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CUX2O14529 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CUX2O14529 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CUX2O14529 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CUX2O14529 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CUX2O14529 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CUX2O14529 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CUX2O14529 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CUX2O14529 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CUX2O14529 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CUX2O14529 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CUX2O14529 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CUX2O14529 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CUX2O14529 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CUX2O14529 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CUX2O14529 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CUX2O14529 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CUX2O14529 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CUX2O14529 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CUX2O14529 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CUX2O14529 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CUX2O14529 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CUX2O14529 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CUX2O14529 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CUX2O14529 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CUX2O14529 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CUX2O14529 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CUX2O14529 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CUX2O14529 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CUX2O14529 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CUX2O14529 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CUX2O14529 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CUX2O14529 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CUX2O14529 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CUX2O14529 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CUX2O14529 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.2 ms