Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms