Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP1O00294 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP1O00294 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP1O00294 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP1O00294 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP1O00294 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP1O00294 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP1O00294 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP1O00294 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP1O00294 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP1O00294 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms