Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
J3QKU1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
J3QKU1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
J3QKU1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
J3QKU1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
J3QKU1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QKU1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QKU1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QKU1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QKU1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QKU1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms