Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA8SH3BPF8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA8SH3BPF8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms