Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PMD0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PMD0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PMD0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PMD0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PMD0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PMD0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PMD0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PMD0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PMD0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PMD0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E9PMD0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PMD0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PMD0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PMD0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PMD0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PMD0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PMD0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PMD0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PMD0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PMD0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PMD0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PMD0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PMD0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PMD0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PMD0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PMD0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PMD0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PMD0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PMD0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PMD0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PMD0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PMD0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PMD0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PMD0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms