Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms