Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms