Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms