Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIT2A6NDA9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIT2A6NDA9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIT2A6NDA9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIT2A6NDA9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIT2A6NDA9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIT2A6NDA9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIT2A6NDA9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIT2A6NDA9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIT2A6NDA9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms