Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS37CA5D8V6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms