Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SSPOA2VEC9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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