Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms