Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 SEC24D-208ENST00000506622 1319 ntTSL 215.37■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 COQ6-209ENST00000554341 1486 ntTSL 1 (best)14.61□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 COQ6-219ENST00000557780 482 ntTSL 513.89□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 SYNJ1-202ENST00000382491 6958 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.385e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 COQ6-202ENST00000394026 1608 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 SYNJ1-201ENST00000357345 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 SYNJ1-211ENST00000630077 6898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 SYNJ1-206ENST00000433931 4852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 COQ6-216ENST00000556588 3119 ntTSL 28.84□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 SEC24D-205ENST00000503683 602 ntTSL 46.29□□□□□ -1.45e-8■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 GNAS-243ENST00000484504 662 ntTSL 229.8■■■□□ 2.364e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-244ENST00000485673 715 ntTSL 529.8■■■□□ 2.364e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.034e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.034e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-228ENST00000469431 702 ntTSL 527.7■■■□□ 2.024e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-235ENST00000478585 543 ntTSL 227.7■■■□□ 2.024e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-257ENST00000604005 693 ntTSL 327.7■■■□□ 2.024e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.024e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-229ENST00000470512 913 ntTSL 526.79■■□□□ 1.884e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-237ENST00000480232 893 ntTSL 526.52■■□□□ 1.844e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-224ENST00000464960 986 ntTSL 226.35■■□□□ 1.814e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)25.39■■□□□ 1.654e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.554e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 521.2■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-240ENST00000481768 1903 ntTSL 1 (best)21.13■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-226ENST00000467321 733 ntTSL 520.26■□□□□ 0.834e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-220ENST00000461152 278 ntTSL 519.51■□□□□ 0.714e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-230ENST00000472183 911 ntTSL 318.98■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-250ENST00000491348 1068 ntTSL 318.98■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-223ENST00000464788 583 ntTSL 217.26■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-249ENST00000490374 675 ntTSL 316.24■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-222ENST00000464624 3764 ntTSL 515.32■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-221ENST00000462499 492 ntTSL 215.03■□□□□ -04e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-241ENST00000482112 704 ntTSL 315.03■□□□□ -04e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-219ENST00000453292 632 ntTSL 514.02□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-206ENST00000349036 581 ntTSL 513.8□□□□□ -0.24e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-252ENST00000493744 812 ntTSL 212.77□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-217ENST00000423897 736 ntTSL 311.88□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-239ENST00000481039 756 ntTSL 511.87□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-247ENST00000488546 897 ntTSL 511.83□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-208ENST00000371075 2551 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.584e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-216ENST00000419558 729 ntTSL 311.36□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-204ENST00000313949 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-218ENST00000450130 595 ntTSL 59.65□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-225ENST00000467227 543 ntTSL 38.76□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 GNAS-227ENST00000468895 583 ntTSL 38.74□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 SPPL2B-205ENST00000589515 1733 ntTSL 522.03■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 YME1L1-208ENST00000491542 912 ntTSL 215.44■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 YME1L1-209ENST00000613434 4127 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 YME1L1-203ENST00000376016 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 TCEA1-202ENST00000517351 539 ntTSL 427.32■■□□□ 1.967e-7■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 PFKL-208ENST00000491298 819 ntTSL 515.29■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 41.6
UTP3Q9NQZ2 SPPL2B-208ENST00000612623 495 ntTSL 517.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-209ENST00000463710 757 ntTSL 318.04■□□□□ 0.482e-14■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 STIP1-210ENST00000540887 877 ntTSL 216.56■□□□□ 0.249e-7■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.358e-10■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 SRM-202ENST00000459997 731 ntTSL 522.2■■□□□ 1.148e-10■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.68□□□□□ -2.31e-9■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 CHD4-208ENST00000540960 892 ntTSL 58.72□□□□□ -1.015e-7■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 41.5
UTP3Q9NQZ2 ACTN4-209ENST00000586538 546 ntTSL 511.9□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 41.4
UTP3Q9NQZ2 MTCH1-203ENST00000418541 602 ntTSL 39.33□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 41.4
UTP3Q9NQZ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.542e-6■■■■■ 41.4
UTP3Q9NQZ2 MIF-203ENST00000498385 435 ntTSL 221.54■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 41.4
UTP3Q9NQZ2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.571e-11■■■■■ 41.4
UTP3Q9NQZ2 MIF-202ENST00000465752 589 ntTSL 1 (best)18.41■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 41.4
UTP3Q9NQZ2 POLD1-209ENST00000597963 737 ntTSL 218.23■□□□□ 0.511e-11■■■■■ 41.4
UTP3Q9NQZ2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 41.4
UTP3Q9NQZ2 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.961e-11■■■■■ 41.4
UTP3Q9NQZ2 HOOK3-205ENST00000533338 774 ntTSL 37.69□□□□□ -1.181e-11■■■■■ 41.4
UTP3Q9NQZ2 RAPGEF2-202ENST00000502485 545 ntTSL 27.07□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 POU2F1-208ENST00000443275 12939 ntTSL 1 (best)5.85□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 LONP1-204ENST00000586617 471 ntTSL 527.26■■□□□ 1.957e-7■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 314.13□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 SEC13-207ENST00000397105 883 ntTSL 222.35■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 GOLGA2-202ENST00000450617 1439 ntTSL 515.65■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 UBC-208ENST00000540700 627 ntTSL 217.97■□□□□ 0.478e-9■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 UBC-204ENST00000536661 624 ntTSL 215.91■□□□□ 0.148e-9■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 UBC-211ENST00000542416 517 ntTSL 49.5□□□□□ -0.898e-9■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 KHSRP-206ENST00000595258 672 ntTSL 516.77■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 RBM26-201ENST00000267229 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 FAM117A-210ENST00000514018 1128 ntTSL 518.81■□□□□ 0.68e-7■■■■■ 41.3
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4301.3 ms