Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R4GMQ9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R4GMQ9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R4GMQ9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R4GMQ9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R4GMQ9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R4GMQ9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R4GMQ9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R4GMQ9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R4GMQ9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R4GMQ9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
R4GMQ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
R4GMQ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R4GMQ9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R4GMQ9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
R4GMQ9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R4GMQ9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
R4GMQ9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
R4GMQ9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R4GMQ9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R4GMQ9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R4GMQ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R4GMQ9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R4GMQ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R4GMQ9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R4GMQ9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R4GMQ9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R4GMQ9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R4GMQ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R4GMQ9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R4GMQ9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R4GMQ9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R4GMQ9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R4GMQ9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
R4GMQ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R4GMQ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
R4GMQ9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms