Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms