Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms