Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHLDA3Q9Y5J5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms