Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB12Q9Y5F1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms