Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms