Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms