Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX2IPQ9Y2D8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms