Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms