Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINS2Q9Y248 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms