Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC2Q9Y235 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms