Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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