Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEU3Q9UQ49 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEU3Q9UQ49 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEU3Q9UQ49 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEU3Q9UQ49 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEU3Q9UQ49 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEU3Q9UQ49 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEU3Q9UQ49 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms