Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms