Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms