Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD1Q9UP38 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms