Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms