Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX2Q9UMQ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BARX2Q9UMQ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms