Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID1Q9ULK0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRID1Q9ULK0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms