Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA11Q9UKX5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms