Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms