Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP8AP2Q9UKL3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP8AP2Q9UKL3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms