Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDC42EP3Q9UKI2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms