Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP21Q9UK80 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms