Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRRDQ9UH36 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms