Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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