Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXTL2Q9UBQ6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms